奇异值分解

奇异值分解

  在了解特征值分解之后，我们知道，矩阵A不一定是方阵。为了得到方阵，可以将矩阵A的转置乘以该矩阵。从而可以得到公式：

  现在假设存在M*N矩阵A，我们的目标是在n维空间中找一组正交基，使得经过A变换后还是正交的。假设已经找到这样一组正交基：

  A矩阵可以将这组正交基映射为如下的形式。

  要使上面的基也为正交基，即使它们两两正交，那么需要满足下面的条件。

  如果正交基v选择为\(A^{T}A\)的特征向量的话，由于\(A^{T}A\)是对称阵，v之间两两正交，那么

  由于下面的公式成立

  所以取单位向量

  可以得到(下面的公式有误，delta_i 应该等于sqrt(lamda_i))

  奇异值分解是一个能适用于任意的矩阵的一种分解的方法，它的形式如下：

  其中，U是一个M*M的方阵，它包含的向量是正交的，称为左奇异向量（即上文的u）。sigma是一个M*N的对角矩阵，每个对角线上的元素就是一个奇异值。V是一个N*N的矩阵，它包含的向量是正交的，称为右奇异向量（即上文的v）。

源码分析

  MLlib在RowMatrix类中实现了奇异值分解。下面是一个使用奇异值分解的例子。

import org.apache.spark.mllib.linalg.Matrix
import org.apache.spark.mllib.linalg.distributed.RowMatrix
import org.apache.spark.mllib.linalg.SingularValueDecomposition
val mat: RowMatrix = ...
// Compute the top 20 singular values and corresponding singular vectors.
val svd: SingularValueDecomposition[RowMatrix, Matrix] = mat.computeSVD(20, computeU = true)
val U: RowMatrix = svd.U // The U factor is a RowMatrix.
val s: Vector = svd.s // The singular values are stored in a local dense vector.
val V: Matrix = svd.V // The V factor is a local dense matrix.

性能

  我们假设n比m小。奇异值和右奇异值向量可以通过方阵\(A^{T}A\)的特征值和特征向量得到。左奇异向量通过\(AVS^{-1}\)求得。 ml实际使用的方法方法依赖计算花费。

• 当n很小（n<100）或者k比n大(k>n/2)，我们会首先计算方阵\(A^{T}A\) ，然后在driver本地计算它的top特征值和特征向量。它的空间复杂度是O(n*n)，时间复杂度是O(n*n*k)。

• 否则，我们用分布式的方式先计算\(A^{T}Av\),然后把它传给ARPACK在driver上计算top特征值和特征向量。它需要传递O(k)的数据，每个executor的空间复杂度是O(n),driver的空间复杂度是O(nk)

代码实现

def computeSVD(
      k: Int,
      computeU: Boolean = false,
      rCond: Double = 1e-9): SingularValueDecomposition[RowMatrix, Matrix] = {
    // 迭代次数
    val maxIter = math.max(300, k * 3)
    // 阈值
    val tol = 1e-10
    computeSVD(k, computeU, rCond, maxIter, tol, "auto")
}

  computeSVD(k, computeU, rCond, maxIter, tol, "auto")的实现分为三步。分别是选择计算模式，\(A^{T}A\)的特征值分解，计算V,U,Sigma。 下面分别介绍这三步。

• 1 选择计算模式

val computeMode = mode match {
     case "auto" =>
       if (k > 5000) {
         logWarning(s"computing svd with k=$k and n=$n, please check necessity")
       }
       if (n < 100 || (k > n / 2 && n <= 15000)) {
         // 满足上述条件，首先计算方阵，然后本地计算特征值，避免数据传递
         if (k < n / 3) {
           SVDMode.LocalARPACK
         } else {
           SVDMode.LocalLAPACK
         }
       } else {
         // 分布式实现
         SVDMode.DistARPACK
       }
     case "local-svd" => SVDMode.LocalLAPACK
     case "local-eigs" => SVDMode.LocalARPACK
     case "dist-eigs" => SVDMode.DistARPACK
}

• 2 特征值分解

val (sigmaSquares: BDV[Double], u: BDM[Double]) = computeMode match {
     case SVDMode.LocalARPACK =>
       val G = computeGramianMatrix().toBreeze.asInstanceOf[BDM[Double]]
       EigenValueDecomposition.symmetricEigs(v => G * v, n, k, tol, maxIter)
     case SVDMode.LocalLAPACK =>
       // breeze (v0.10) svd latent constraint, 7 * n * n + 4 * n < Int.MaxValue
       val G = computeGramianMatrix().toBreeze.asInstanceOf[BDM[Double]]
       val brzSvd.SVD(uFull: BDM[Double], sigmaSquaresFull: BDV[Double], _) = brzSvd(G)
       (sigmaSquaresFull, uFull)
     case SVDMode.DistARPACK =>
       if (rows.getStorageLevel == StorageLevel.NONE) {
         logWarning("The input data is not directly cached, which may hurt performance if its"
           + " parent RDDs are also uncached.")
       }
       EigenValueDecomposition.symmetricEigs(multiplyGramianMatrixBy, n, k, tol, maxIter)
   }

  当计算模式是SVDMode.LocalARPACK和SVDMode.LocalLAPACK时，程序实现的步骤是先获取方阵\(A^{T}A\) ，在计算其特征值和特征向量。 获取方阵无需赘述，我们只需要注意它无法处理列大于65535的矩阵。我们分别看这两种模式下，如何获取特征值和特征向量。

  在SVDMode.LocalARPACK模式下，使用EigenValueDecomposition.symmetricEigs(v => G * v, n, k, tol, maxIter)计算特征值和特征向量。在SVDMode.LocalLAPACK模式下，直接使用breeze的方法计算。

  在SVDMode.DistARPACK模式下，不需要先计算方阵，但是传入EigenValueDecomposition.symmetricEigs方法的函数不同。

private[mllib] def multiplyGramianMatrixBy(v: BDV[Double]): BDV[Double] = {
   val n = numCols().toInt
   //v作为广播变量
   val vbr = rows.context.broadcast(v)
   rows.treeAggregate(BDV.zeros[Double](n))(
     seqOp = (U, r) => {
       val rBrz = r.toBreeze
       val a = rBrz.dot(vbr.value)
       rBrz match {
         //计算y += x * a
         case _: BDV[_] => brzAxpy(a, rBrz.asInstanceOf[BDV[Double]], U)
         case _: BSV[_] => brzAxpy(a, rBrz.asInstanceOf[BSV[Double]], U)
         case _ => throw new UnsupportedOperationException
       }
       U
     }, combOp = (U1, U2) => U1 += U2)
 }

  特征值分解的具体分析在特征值分解中有详细分析，请参考该文了解详情。

• 3 计算U,V以及Sigma

//获取特征值向量
val sigmas: BDV[Double] = brzSqrt(sigmaSquares)
val sigma0 = sigmas(0)
val threshold = rCond * sigma0
var i = 0
// sigmas的长度可能会小于k
// 所以使用 i < min(k, sigmas.length) 代替 i < k.
if (sigmas.length < k) {
  logWarning(s"Requested $k singular values but only found ${sigmas.length} converged.")
}
while (i < math.min(k, sigmas.length) && sigmas(i) >= threshold) {
  i += 1
}
val sk = i
if (sk < k) {
  logWarning(s"Requested $k singular values but only found $sk nonzeros.")
}
//计算s，也即sigma
val s = Vectors.dense(Arrays.copyOfRange(sigmas.data, 0, sk))
//计算V
val V = Matrices.dense(n, sk, Arrays.copyOfRange(u.data, 0, n * sk))
//计算U
// N = Vk * Sk^{-1}
val N = new BDM[Double](n, sk, Arrays.copyOfRange(u.data, 0, n * sk))
var i = 0
var j = 0
while (j < sk) {
    i = 0
    val sigma = sigmas(j)
    while (i < n) {
      //对角矩阵的逆即为倒数
      N(i, j) /= sigma
      i += 1
    }
    j += 1
}
//U=A * N
val U = this.multiply(Matrices.fromBreeze(N))  

参考文献

【1】强大的矩阵奇异值分解(SVD)及其应用

【2】奇异值分解(SVD)原理详解及推导

【3】A Singularly Valuable Decomposition: The SVD of a Matrix